Duda baja laboral

Estimados señores, en la actualidad tengo una invalidez en grado total para profesion habitual de la cual cobro el 55%, en estos momentos estoy trabajando y mi contrato termina el 31 de diciembre, actualmente estoy de baja laboral por intervención quirúrgica y mi empresa me paga por ello, cuando termine el contrato, ¿quien me pagara? Tengo derecho a ello a pesar de estar cobrando una pensión del inss, que según me han dicho es con quien mi empresa tiene contratada las contingencias comunes, existe conflicto al ser la misma entidad pagadora en caso de que tenga derecho.